Die heutige Aalener Stadtkirche und ihr Vorgängerbau beherbergten über Jahrhunderte immer wieder hervorragende Orgeln von den besten Orgelbauern der jeweiligen Zeit. Angefangen mit der Orgel in der alten Stadtkirche, für die der berühmte Orgelbauer Paul Prescher gewonnen werden konnte, über die Orgel des "süddeutschen Silbermann" Georg Friedrich Schmahl bis zum Werk der Gebrüder Link, die für ihre technisch und klanglich herausragenden Werke bekannt waren, war die Stadtkirche immer nicht nur ein geistiges, sondern auch ein musikalisches Zentrum der Stadt Aalen.
Im letzten Jahrhunderts wurden die hohen Ansprüche an die Stadtkirchenorgel leider aufgegeben, und so wurden ohne akute Not mehrfach tiefgreifende Veränderungen an der vorhandenen Substanz vorgenommen. Deren mangelhafte Planung und Qualität führt heute dazu, dass das gegenwärtige Instrument in einem sehr schlechten Zustand ist. Eine Reparatur ist weder ökonomisch noch musikalisch sinnvoll und wünschenswert.
| 1671 – 1765 | 1769 – 1886 | 1886 – 1947 | 1947 – 1959 | 1959 – 2008 | ab 2009 |
| Die Prescher-Orgel | Die barocke Schmahl-Orgel | Die romantische Link-Orgel | Der erste Orgelumbau Bornefelds | Der zweite Orgelumbau | Die neue Rieger-Orgel |
Die Geschichte der Orgeln ist eng an die Geschichte der Stadtkirche gekoppelt. Hier wird die Baugeschichte der Kirche kurz umrissen.